Les microbes pathogènes des cultures sont nos ennemis pour plusieurs raisons : ils menacent la sécurité alimentaire, entraînent de lourdes pertes économiques et nuisent à la santé publique et environnementale principalement en raison de la quantité de pesticides nécessaire à leur contrôle.
Le chancre citrique causé par la bactérie Xanthomonas citri (Xci) est une maladie des agrumes tels que les oranges, les citrons, les mandarines et les pamplemousses, ainsi que d’autres plantes de la famille des Rutacées. Elle cause d’importantes pertes de rendement pour les agriculteurs dans l’ensemble des zones de production.
Adrien Rieux, Fourni par l’auteur
Afin de mieux gérer les maladies actuelles des cultures et prévenir les épidémies futures, il est nécessaire d’acquérir une compréhension approfondie des facteurs sous-jacents à l’émergence, l’adaptation et la propagation des microbes pathogènes.
La paléogénomique comme outil de lutte
Dans cette optique, la paléogénomique, discipline scientifique qui consiste à étudier les génomes d’individus anciens, morts depuis des dizaines ou milliers d’années, a permis des avancées majeures et originales dans l’étude des maladies infectieuses. Un exemple, probablement le plus connu, concerne l’étude des différentes épidémies de Peste à partir d’ossements archéologiques dans le but de comprendre les différentes phases de son expansion.
Grâce à des échantillons anciens provenant d’une dizaine d’herbiers de muséums d’histoire naturelle ainsi que d’isolats récoltés plus récemment sur le terrain, notre équipe de scientifiques du CIRAD et du MNHN a réussi à reconstruire l’histoire évolutive de la bactérie Xci, illustrant le lien majeur existant entre le développement de l’agriculture et l’émergence des agents…
La suite est à lire sur: theconversation.com
Auteur: Adrien Rieux, Chercheur en génomique évolutive des microbes pathogènes, Cirad
